Kunis sinh ra tại Chernivtsi, trong Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Xô Viết Ukraina. Mẹ cô, bà Elvira, là một giáo viên vật lý, quản lý một hiệu thuốc, và cha cô, Mark Kunis, là một kỹ sư cơ khí làm tài xế taxi. Kuniscó một người anh trai lớn hơn cô 6 tuổi tên là Michael. Năm 2011 cô phát biểu rằng cha mẹ cô có "công việc tuyệt vời", và rằng gia đình là "rất may mắn" và "không nghèo"; họ đã quyết định rời khỏi Liên Xô năm 1991, khi cô mới bảy tuổi, gia đình cô chuyển đến Los Angeles, California với 250 USD. "Đó là tất cả chúng tôi được phép mang theo. Cha mẹ tôi đã từ bỏ công việc tốt và bằng cấp, không được chuyển nhượng được. Chúng tôi đến New York vào ngày thứ 4 và sáng thứ Sáu anh tôi và tôi đã được tại trường học ở LA".